احترام متقابل دولت روحانی و رئیس سابق ستاد کل نیروهای مسلح
در انتخابات ریاست جمهوری 92، حسن روحانی در فیلم انتخاباتی اش بخشی از سخنرانی فیروزآبادی را پخش کرد که می گفت روحانی ریاست مدبرانه و توام با اخلاق و رفاقت داشته و «حقیقتا» لقب استاد در امنیت ملی و مدیریت بحران» شایسته روحانی است. فیروزآبادی پس از انتخابات هم از راهکار اقتصادی دولت دفاع کرد، و سخنرانی روحانی در سازمان ملل را «درخشش عقلانیت روحانیت شیعه در سازمان ملل» توصیف کرد. وی دیپلماسی دولت روحانی را مثبت و سازنده و «فرصت تاریخی» توصیف کرد و در اردیبهشت 93 در انتقادی تند از رسانه های مرتبط با نیروهای مسلح خواست که در مواجهه با دولت روش شان را اصلاح کنند.
سرلشکر فیروزآبادی همچنین ضمن حمایت صریح از روحانی گفت: «باید به وجود ایشان افتخار کنیم.» این سخنان با استقبال گسترده دولتی ها مواجه شد و حسام الدین آشنا، مشاور حسن روحانی از آن به عنوان یک فرمان یاد کرد و مجید انصاری، معاون پارلمانی دولت روحانی آن را ابلاغ دستور مقام معظم رهبری به رسانه های وابسته به نظامیان توصیف کرد. با این حال و پس از مدتی روشن شد که مخالفان روحانی برای فیروزآبادی شأن فرمانده و فرمان قائل نیستند و به راه خود ادامه می دهند. او همین طور مذاکرات هسته ای را مثبت دانست و در آذر 93 گفت: «از روزهای نخست اعلام کرده ام که جزو افرادی هستم که این مذاکرات را یک فرصت و پیشنهاد خوب می دانم و نقش ظریف و همکارانش در این مذاکرات را جهادگونه ارزیابی می کنم.»
16 فروردین 94 او در اوج مذاکرات هستهای، در نامه ای به مقام معظم رهبری امضای بیانیه لوزان و موفقیت تیم هستهای ایران را به ایشان تبریک گفت. حمایت های او از مذاکرات چندان به مذاق رسانه های اصولگرا خوش نیامد و حتی رهبر معظم انقلاب نیز تلویحا از نامه 16 فروردین 94 فیروزآبادی انتقاد کردند و گفتند تبریک معنی ندارد. حسن فیروزآبادی در طول سه سال گذشته همزمان با حمایت ویژه از حسن روحانی مقابل هاشمی ایستاد؛ از رد صلاحیت او ابراز خوشحالی کرد و از این که برخی شورای رهبری را مطرح می کنند، انتقاد کرد و گفت او «امامت فتنه گران» را برعهده داشته است. برخی معتقدند این انتقادها احتمالا برای توازن وضعیت اش طرح شده ولی به نظر نمی رسد برای جبران حمایت های او از حسن روحانی کافی باشد.
در 16 فروردین 1394 و پس از پایان مذاکرات لوزان، سرلشکر فیروزآبادی موفقیت تیم مذاکره کننده هسته ای را به رهبر معظم انقلاب تبریک گفت. اقدامی که واکنش تندروها و اصولگرایان را در پی داشت. در همین راستا سایت رجانیوز نوشت: «از فیروزآبادی انتظار می رود به عنوان نماد قوه قاهره نظام به «بدبینانه ترین زوایای یک توافق بین المللی» بپردازد و جایگاه او اقتضا می کند که «کوچکترین احتمالات برای ناامن شدن کشور» را مسدود کند، اما «جابجایی نقش ها و تلاش برای دیدن خوشبینانه ترین وجوه توافق، از سوی رئیس ستاد کل نیروهای مسلح، امری است که قطعا مغایر با جایگاه سازمانی جناب فیروزآبادی تحلیل خواهد شد و از آن برداشت ذوق زدگی کل نظام درباره یک توافق غیرقابل دفاع در مجامع بین المللی صورت می گیرد.»
سردار سرلشکر محمد باقری
پایان 27 سال ریاست
فیروزآبادی در سال 1369 از سوی رهبر معظم انقلاب به عنوان رئیس ستاد کل نیروهای مسلح کشور منصوب شد و سرانجام در تاریخ هشتم تیرماه سال 95 با حکم رهبر معظم انقلاب جای خود را به سردار سرلشکر محمد باقری داد و اکنون به عنوان مشاور عالی نظامی فرمانده معظم کل قوا خدمت می کند. برکناری فیروزآبادی با حاشیه های زیادی همراه بود. برخی برکناری او را به این دلیل می دانستند که او برخلاف باقری سابقه نظامی رسمی نداشت و برخی هم حمایت های بی چون و چرایش از برجام را دلیل آن می دانستند. این مسئله احتمالا در گذشته، زمانی که سپاه و ارتش جدا بودند و فعالیت های مجزایی داشتند چندان اهمیت نداشت. سپاه تا همین اواخر تنها بازوی نظامی ایران برای عملیات برون مرزی بود.
اما اعزام ارتش به سوریه برای اولین مرتبه در اوایل امسال حاکی از یک تغییر اساسی است. فعالیت ارتش از دفاع از مرزهای کشور به حمایت از سپاه در دفاع و صدور انقلاب اسلامی در حال گسترش است. اسماعیل کوثری، رئیس کمیته دفاعی مجلس نهم هم پیرامون حضور سرلشکر باقری به عنوان ریاست جدید ستاد کل نیروهای مسلح کشورمان و ارزیابی عملکرد سرلشکر فیروزآبادی به میزان گفت: «سرلشکر فیروزآبادی بعد از پذیرش قطعنامه در جنگ تحمیلی به عنوان رئیس ستاد نیروهای مسلح معرفی شدند و حدود 26 سال کار را در این ستاد به جلو بردند.» وی همچنین با اشاره به این که وضعیت جسمی سرلشکر فیروزآبادی اخیرا تحلیل رفته بود تاکید کرد: «وی تحت معالجه درمانی قرار دارد از این رو در جایگاه مشاور عالی قرار گرفته اند.»